Daniel Sdunek begann das Handballspielen in seinem Geburtsort in Essen beim TUSEM Essen. Im Jahr 2003 wechselte er von seinem Ausbildungsverein zur HSG Düsseldorf, bevor es ihn zur Saison 2006/2007 zum TV 08 Willstätt-Ortenau zog. Dort spielte er für zwei Saisons und wechselte daraufhin zur HR Ortenau, wo er ein Jahr seiner aktiven Handballkarriere verbrachte. Im Sommer 2009 wechselte Daniel Sdunek zum damligen Zweitligisten TVB Stuttgart. Er gehörte der Aufstiegsmannschaft der WILD BOYS an, die am Ende der Saison 2014/2015 den ersten Aufstieg in die höchste Spielklasse Deutschlands für den TVB Stuttgart perfekt machte. Zur Saison 2015/2016 zog es den gebürtigen Essen zur TGS Pforzheim in die dritte Liga. Nach zwei Jahren in Pforzheim kehrte Daniel Sdunek zum TVB Stuttgart zurück und bestritt am 10. Dezember 2017 im Heimspiel gegen den SC DHfK Leipzig sein erstes Bundesligaspiel für die WILD BOYS. 

Seine Trainerkarriere als Torwart-Trainer begann 2019/2020 mit dem Training von den Jugend-Torhütern des TVB. Im Januar 2023 übernahm der DHB Torhütertrainer Lizenz-Inhaber die Leitung des Torwarttraineramts der Bundesligamannschaft bei den WILD BOYS.